台灣西南海岸早期有海灣的潟湖地形，常稱作內海仔。台南地區的倒風內海包括今之北門、佳里、新營、鹽水、下營、 麻豆等，有鹽水、下營、茅港尾、麻豆等古港口，麻豆有股港口遺跡留存，台灣史學者翁佳音認為麻豆一般都認為是平埔語眼睛之意思，他提出麻豆可能是台語碼頭的語音，當地曾進行歷史考古進而設立倒風內海故事館。台江內海包括七股、將軍、佳里、西港、 安定、新市、永康、台南市區至高雄茄萣等區，是早期泛稱大員的範圍，翁佳音也認為大員就是台江內海大海灣的「大灣」。1820年代後快速陸化，見證台南地區倉海田的地理變遷。2009年成立台江國家公園(第八座國家公園)，總面積390多平方公里，有濕地、沙洲、紅樹林、黑面琵鷺、鹽業、荷蘭時代海堡殘跡、清治時代四草砲台等自然人文資源，是比較特別的都會型國家公園。再往南的高屏海岸也是大型的沙洲潟湖地形，陸續開發建設興達港、左營港、高雄港等大型港口。屏東的大鵬灣舊名稱是茄藤港，是林邊溪沖積形成的囊狀潟湖，日治時代曾作為海軍航空隊基地，現也成立大鵬灣國家風景區。
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