部分民眾以為水菸的危害比紙菸小，國健署表示，根據世界衛生組織資料顯示，水菸常見主成分為菸草，其加熱時使用木渣、木炭等燃料，會產生含有大量一氧化碳、金屬和致癌化學物等，使用1小時的水菸，吸入的菸霧量是單支紙菸吸入量的100至200倍，對呼吸道和心血管系統同樣會產生急性及長期危害，且可能增加冠狀動脈疾病和慢性阻塞性肺病的風險，因此無論是水菸或紙菸，都對身體產生危害。
依據國民健康署111年大專院校學生吸菸及健康行為調查結果發現，有5.0%的大專校院學生曾經使用水菸，高於109年的3.6%、107年的1.8%，顯見水菸逐漸獲得學生的使用，國健署呼籲年輕族群，為維護自身健康，不要因好奇心驅使或同儕壓力而輕易嘗試，使用水菸一樣有害健康，要拒絕任何形式的菸品。