南榮科技大學經歷前校長黃聰亮販賣假學歷及欠薪風波，教育部命令於2020年2月停辦，但最近申請改制為國際中小學，已獲教育部私校諮詢會通過。高教工會及全國教師工會總聯合會呼籲教育部，應嚴正拒絕南榮科大改制續命，應於停辦3年期滿，也就是在今年2月，立刻執行解散。
高教工會組織部主任林柏儀表示，南榮科大停辦後，造成1650個學生被迫轉學，百名教職員被資遣，校方還未給足資遣費，相當惡質。高教工會指出，前校長黃聰亮販賣假學歷案，多位學校董事子女，就是「買學歷者」，董事絕非不知情。而這批涉案董事在學校退場後，還在去年(111年)將董事席次轉手予毫無教育專業背景的民間中小企業業者入主，積極遊說中央與地方政府容許南榮科大改制為私立貴族中小學「續命」，毫無正當性可言。
全教總理事長侯俊良表示，在《私校退場條例》實施後，教育部如何處理南榮科大的案子將非常具有指標性，若惡質董事會還可以改辦，後果不堪設想。
對此，教育部以書面回應表示，南榮科大停辦後，學生均已安置，另向退場基金融資用於支付教職員工薪資、退撫儲金提撥、公保、勞保及健保費、勞工退休金及教職員超額年金，共6,798萬5,754元，學校(法人)已於111年7月30號全數清償，目前已無負債。
法人於111年5月24號函送法人改善計畫擬新設雙語國小計畫書到教育部，經教育部多次函送臺南市政府及學者專家審查後，於111年12月14號提送私校諮詢會諮詢意見，私校諮詢會建議通過法人所送改善計畫，後續法人應於今年(112年)1月31號前取得臺南市政府同意新設雙語國小籌設許可。
教育部表示，法人若於期限內未獲籌設許可，教育部將依《私立高級中等以上學校退場條例》第21條第4項規定命該法人解散清算，賸餘校產僅得歸屬中央機關、地方政府、公立學校或退場基金。