為鼓勵病理學學習表現優異學生，慈濟大學成立「許永祥教授獎學金」，第一屆獲獎學生共8位，許教授遺孀卓麗貞老師特別勉勵獲獎學生，不要忘記許教授對病理學基礎的重視，未來持續在專業的路上努力。
自1996年起擔任慈濟大學病理學科主任，許永祥教授今（111）年5月離世後，延續許教授的教育愛，慈大醫學系系友共同設立「許永祥教授獎學金」。卓麗貞老師分享，許永祥教授生前嚴格要求學生，務必把病理學好，因為病理是所有疾病的基礎，病理懂了，很多疾病就通了，她強調，這是許老師對病理的重視與堅持。她也感謝學校、校友、同事及好友們的支持，匯聚力量，延續這份病理精神。
「許永祥教授獎學金」獎助對象包括醫學系、醫學檢驗生物技術學系、學士後中醫學系、護理學系、物理治療學系。由各學系主任依據病理學相關課程學業成績表現優異推薦，經評核審定後核發。第一屆「許永祥教授獎學金」獲獎學生為醫學系邱郁婕、醫學檢驗生物技術學系歐陽竫、學士後中醫學系賴荻文、學士後中醫學系鄭仲伶、護理學系吳怡昕、護理學系張婕妤、護理學系陳正庭、物理治療學系張晉嘉。
其中，獲獎的醫學系邱郁婕同學，同時也是許永祥教授的導生，她回憶，許教授即使身體已發出警訊，依然強忍不適，站在講臺上為學生講解病理課，鼓勵學生「一日有燈就要讀書」，她表示，會記得教授的教誨，也會秉持做學問該有的態度，銘記未來成為醫生該負的責任。