今年國中教育會考自然科為 108 新課綱第一屆，因應 108 新課綱以核心素養為主軸、探究與實作為方向，今年會考自然科題數降低為 50 題，除了生物科、理化科、地球科學外，另外加入跨科主題的學習內容。題型分布與往年相仿，生物、地科和跨科約占 50%，理化約占50%，自然科老師們表示，整體而言，自然科試題難易適中、具有鑑別度。
在教育部舉行的國中教育會考自然科解題記者會上，生物科由臺北市立萬華國中老師王美玲解說，理化由臺中市立忠明高中老師賴志忠、臺中市立中港高中 老師張文昭解說，地科由新北市立永平高中老師沈文俊解說。
王美玲老師表示，試題由基本觀念題型出發，漸次發展到高層次的活用題，結合學生生活經驗，涵蓋重要學習觀念，難易適中且具鑑別度，符合108新課綱自然科素養導向的命題特色，圖表題近6成。
老師們表示，試題結合學生日常生活經驗中常見的素材，強調應用知識與技能解決真實情境脈絡中的問題，像是第 7 題「在高山上看密封包裝的洋芋片外包裝變化、來判斷兩人對話論點的正確性」、第 37 題「觀察海邊海浪變化，判斷當地滿潮或乾潮時間」、題組第 49-50 題「透過『月猜月快』月相卡牌遊戲來判斷農曆日期數字大小推論月相的關係，並延伸到玩卡牌時神經傳遞路徑的生物科內容」。
另外，第 8、27、19 題，涵蓋 108 課綱自然科學領域國中階段三大跨科主題「從原子到宇宙」、「能量與能源」、「全球氣候變遷與調適」。