諾富特、華航事件逐漸延燒，指揮中心表示，在諾富特方面雖然到今(10)天還有員工確診，不過整個案子的相關人員都已經在集中檢疫所檢疫，有狀況會立即送醫，再加上外包工讀等有接觸者大約80名，都已經在隔離中，屬於可控制的案件，但是華航在境外、模擬機艙、交通車感染的風險仍擔憂內部可能有多重病毒傳播鍊，因此決定改變清零計畫至2.0。
指揮中心指揮官陳時中表示，規劃將前艙機組員全數召回檢疫，若在國外一入境就要進到集中檢疫所、後艙機組員曾派飛非長程航班，或有接觸風險機組員者，全數檢疫14天、相關機組員進入社區須採檢陰性、風險阻與安全組不能混飛。
指揮官陳時中說，清零計畫2.0會讓華航陸續停飛14天，對客運、貨運都會造成非常大的影響，但這是為了臺灣的社區安全，「不得不做的痛苦決定」，雖然對機組員生活會造成很大的影響，但至少要讓前後端先堵住病毒傳播鍊，才能有效阻絕病毒在社區傳播。