武漢肺炎疫情延燒衝擊全球，多國校園相繼宣布停課或改為線上教學，國立臺灣海洋大學除了持續舉辦「網路教學工作坊」，為教師增能外，目前也已經開設近150門網路教學課程，提供大班課程與中港澳及無法到班上課的學生線上授課服務。
針對100人以上大班級及講座課程實施分班、分散場地或網路教學，校園大型活動也取消或調整辦理方式，藝文活動改採戶外演出。
而為了面對愈趨嚴峻的疫情考驗，海大特別設置獨棟的「防疫宿舍」，提供需要居家檢疫、居家隔離的學生入住，或讓自主管理期間出現發燒或呼吸道症狀的同學申請，提醒同學確實記錄每日早晚體溫及身體健康狀況，檢疫期間遵守不外出，避免群聚感染。