考量小校小班衍生的各種教育困境，花蓮縣三民國小以差異化教學、個人化學習的教育理念，推出「混齡+協同」的教學模式，增進學生學習效果與人際互動，並將傳統教室加以改造，成為全國首座專屬差異化教學、個人化學習的教室。
三民國小在2016年公辦民營為KIST學校後，便以差異化教學、個人化學習為理念，投入小校創新教學研發，經過兩年驗證，推出「混齡+協同」的教學模式。三民國小校長黃佑民指出，即使只有一個班，班上孩子的學習本來就有差異，就算兩個年級一起上課，差異也沒有增加多少，所以，所謂的「混齡教學」，其實只是習慣的改變。重要的是，混齡之後，一個班上就會有兩位老師，這兩位老師就能共備、協同教學，遠比原來的單打獨鬥來得好。
為了符合「混齡+協同」的需求，三民國小還在老師建議下，改造傳統教室。黃校長表示，改造後的教室，除了舊有的大黑板，教室左前方與右後方，也各增加一面中型黑板，方便差異化分組教學的進行；傳統課桌椅也換成半月形學習桌，不僅面積變大，還可以任意拼接分組，讓學生可以小組討論或個人學習。另外，關照學生情緒，教室內還設置了情緒角落，讓孩子可以舒緩情緒，重新學習。
三民國小以「混齡+協同」的教學模式，兩年來，除了學生課堂參與度提升外，也在全縣學力檢測中獲得良好成績，透過教室改造，可以讓教師教學更順暢，也讓學生在更適合的環境中學習。