教育部長吳茂昆今天請辭獲准，行政院長賴清德今天傍晚在立法院接受媒體訪問時表示，吳部長在上周末(26日)透過行政院秘書長卓榮泰口頭請辭，今天上午他與吳部長通過電話，請辭原因是2005年吳茂昆代表台灣到中國蘇州參加國際學術會議(ICSU)，會議後再轉到杭州，參加由香港科技大學與浙江大學合辦的國際學術高峰會議。當時兩個行程他都向行政院提出申請，但是到最近立委質詢，他才得知當時行政院只准許蘇州的行程，因此，他決定以高標準要求自己，辭去教育部長職務。
對於吳茂昆的決定，賴院長說，他表示支持，因此准辭，至於教育部長一職，將由次長暫代，待接任人選確定後，會對外公布。